TP8 – Le mode d’action des enzymes

« TP8 – Le mode d’action des enzymes Les enzymes sont des catalyseurs biologiques.

L’amylase catalyse l’hydrolyse de l’amidon au cours de la digestion.

Le site actif de l’amylase permettant cette hydrolyse comporte 3 acides aminés importants : Glu233, Asp300 et Asp197. On connaît une amylase mutée pour laquelle l’hydrolyse de l’amidon est impossible. Problème posé : Comment expliquer l’absence d’activité enzymatique de l’amylase mutée ? A partir du matériel disponible, vous devrez expliquer l’absence de l’activité catalytique de l’amylase mutée. Matériel : - PC équipé des logiciels GenieGen2 et LibMol + Documents 1 à 4 - séquences ADN et protéiques de différentes amylases (Amylase pancréatique.edi) modèles moléculaires d’amylase fonctionnelle de porc (amylase_amidon.pdb) modèle moléculaire d’amylase mutée humaine (amylase_pancreatique_humaine_mutee.pdb) ETAPE 1 : Proposez une stratégie expérimentale Proposez une démarche pour identifier la nature de la mutation portée par l’amylase mutée. Appelez le professeur pour vérification ETAPE 2 : Mettez en œuvre le(s) protocole(s) proposé(s) 1.

IDENTIFIER UNE MUTATION DANS LES SEQUENCES DE L’AMYLASE a. b. c. d. e. f. g. Accéder à GenieGen2 : https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/geniegen2/ Cliquer sur « Charger des séquences (edi, pdb) » Sur le réseau, sélectionner « Amylase pancréatique.edi » Cocher les séquences à comparer (ADN ou Protéines) Dans le menu « Actions », choisir « Aligner les séquences » Identifier la mutation dans la partie « Séquences alignées » qui s’affiche alors Modifier éventuellement la barre de numérotation (compte des nucléotides ou des acides aminés) pour identifier la position de la mutation Appelez le professeur pour vérification de la capture d’écran 2.

IDENTIFIER LA STRUCTURE DU SITE ACTIF 1234567891011123. Accéder à https://libmol.org/ Dans l’onglet «.... »